ОЦЕНКА ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ КАЛМЫЦКОЙ ПОРОДЫ КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА РЕСПУБЛИКИ КАЛМЫКИЯ НА ОСНОВЕ ПОЛНОГЕНОМНОГО АНАЛИЗА

Иван Федорович Горлов; Марина Ивановна Сложенкина; Юрий Николаевич Федоров; Елена Юрьевна Анисимова; Екатерина Владимировна Карпенко; Кермен Евгеньевна Бадмаева; Виктория Саналовна Убушиева

doi:10.31857/2500-2082/2023/6/80-83

Иван Федорович Горлов, академик РАН ФГБОУ ВО «Волгоградский государственный технический университет» ФГБНУ «Поволжский научно-исследовательский институт производства и переработки мясомолочной продукции»,
Марина Ивановна Сложенкина, член-корреспондент РАН ФГБНУ «Поволжский научно-исследовательский институт производства и переработки мясомолочной продукции», ФГБОУ ВО «Волгоградский государственный технический университет»
Юрий Николаевич Федоров, член-корреспондент РАН ФГБНУ Всероссийский научно-исследовательский и технологический институт биологической промышленности
Елена Юрьевна Анисимова, кандидат биологических наук ФГБНУ «Поволжский научно-исследовательский институт производства и переработки мясомолочной продукции»
Екатерина Владимировна Карпенко, кандидат биологических наук ФГБНУ «Поволжский научно-исследовательский институт производства и переработки мясомолочной продукции»
Кермен Евгеньевна Бадмаева, кандидат биологических наук ФГБНУ «Поволжский научно-исследовательский институт производства и переработки мясомолочной продукции»
Виктория Саналовна Убушиева, соискатель ФГБНУ «Поволжский научно-исследовательский институт производства и переработки мясомолочной продукции»

DOI: https://doi.org/10.31857/2500-2082/2023/6/80-83

Аннотация

В статье представлены результаты оценки биоразнообразия аборигенных породных ресурсов крупного рогатого скота Республики Калмыкия на основе полногеномного генотипирования. Объект изучения – биоматериал, полученный от поголовья КРС калмыцкой породы, выращиваемого в Калмыкии (n = 20). Дополнительно были взяты генотипы калмыцкой породы, имеющиеся в ОНИС БиоТехЖ (ФГБНУ ФИЦ ВИЖ имени Л.К. Эрнста, г. Москва). Препараты по своим качественным и количественным характеристикам пригодны для проведения полногеномных исследований с применением ДНК-чипов. Концентрация двухцепочечной ДНК в образцах варьировала от 16 до 80 нг/мкл, соотношение OD260/OD280 – от 1,77 до 2,12, эффективность генотипирования (call rate) – от 99,72 до 99,84%. Впервые получены данные об уровне генетического разнообразия в популяциях калмыцкой породы крупного рогатого скота Республики Калмыкия с применением ДНК-чипов высокой плотности, и выполнено сравнение рассчитанных популяционно-генетических показателей с тремя породами турано-монгольского происхождения. Калмыцкая порода характеризовалась наиболее высоким уровнем генетического разнообразия, что может быть следствием использования естественной случки при разведении, а также относительно высокой численности популяции, по сравнению с другими породами. Из-за малочисленности поголовья в якутской породе минимальный уровень генетического разнообразия. Результаты исследования найдут применение при разработке программ разведения и сохранения калмыцкой породы КРС.

Литература

1. Генджиева О.Б., Сулимова Г.Е. Изучение генетического разнообразия калмыцкого скота с использованием ISSR-фингерпринтинга // Зоотехния. 2009. № 3. С. 4-5.
2. Зиновьева Н.А., Доцев А.В., Сермягин А.А. и др. Изучение генетического разнообразия и популяционной структуры российских пород крупного рогатого скота с использованием полногеномного анализа SNP // Сельскохозяйственная биология. 2016. Т. 51. № 6. С. 788-800.
3. Ковальчук А.М. Генетическое разнообразие казахской белоголовой породы крупного рогатого скота // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2021. № 6 (92). С. 283-289.
4. Моисейкина Л.Г., Каюмов Ф.Г., Чимидова Н.В. и др. Аллелофонд крупного рогатого скота калмыцкой породы разных зональных типов // Сборник научных трудов SWorld. 2013. Т. 49. № 4. С. 6-12.
5. Улимбашев М.Б., Гостева Е.Р., Краснова О.А. и др. Состояние мясных породных ресурсов крупного рогатого скота России (обзор) // Генетика и разведение животных. 2023. № 1. С. 52-64.
6. Федоров В.Х., Приступа В.Н., Бабкин О.А., Торосян Д.С. Совершенствование скота калмыцкой породы : монография / под общей редакцией О.А. Бабкина. Персиановский: Донской ГАУ, 2021. 168 с.
7. Чимидова Н.В., Моисейкина Л.Г., Болдырев Б.А., Черунова И.В. Генетическое сходство калмыцкого скота племенных хозяйств республики Калмыкия // Современные проблемы науки и образования. 2013. № 2. С. 486.
8. Чимидова Н.В., Моисейкина Л.Г., Убушиева А.В. и др. Изменения генофонда скота калмыцкой породы // Животноводство и кормопроизводство. 2020. Т. 103. № 4. С. 65-73.
9. Чимидова Н.В., Моисейкина Л.Г., Убушиева А.В. и др. Генетическое сходство калмыцкого скота в племенных хозяйствах республики Калмыкия // Аграрно-пищевые инновации. 2021. № 4 (16). С. 28-35.
10. Юдин Н.С., Ларкин Д.М. Происхождение, селекция и адаптация российских пород крупного рогатого скота по данным полногеномных исследований // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2019. Т. 23. № 5. С. 559-568.
11. Abdelmanova A.S., Kharzinova V.R., Volkova V.V. et al. Comparative Study of the Genetic Diversity of Local Steppe Cattle Breeds from Russia, Kazakhstan and Kyrgyzstan by Microsatellite Analysis of Museum and Modern Samples // Diversity. 2021. Vol. 13. № 8. Article 351. https://doi.org/10.3390/d13080351.
12. Chimidova N.V., Moiseikina L.G., Ubushieva A.V. et al. Genetic structure of population of the Kalmyk breed cattle // E3S WEB OF CONFERENCES. XV International Scientific Conference on Precision Agriculture and Agricultural Machinery Industry “State and Prospects for the Development of Agribusiness – Interagromash 2022”. Rostov-on-Don, 2022.
13. Sermyagin A.A., Dotsev A.V., Gladyr E.A. et al. Whole-genome SNP analysis elucidates the genetic structure of Russian cattle and its relationship with Eurasian taurine breeds // Genetics Selection Evolution. 2018. Vol. 50. Article 37. https://doi.org/10.1186/s12711-018-0408-8.