ПОИСК ИНФОРМАТИВНЫХ МАРКЕРНЫХ СИСТЕМ, АССОЦИИРОВАННЫХ С ЛОКУСАМИ УСТОЙЧИВОСТИ К СОСУДИСТОМУ БАКТЕРИОЗУ У КАПУСТЫ БЕЛОКОЧАННОЙ

Елена Викторовна Дубина; Юлия Александровна Макуха; Сергей Валентинович Гаркуша; Олеся Леонидовна Горун; Сергей Александрович Лесняк

doi:10.31857/S2500208224010034

Елена Викторовна Дубина, доктор биологических наук, профессор РАН ФГБНУ «Федеральный научный центр риса»
Юлия Александровна Макуха, кандидат биологических наук ФГБНУ «Федеральный научный центр риса»
Сергей Валентинович Гаркуша, член-корреспондент РАН ФГБНУ «Федеральный научный центр риса»
Олеся Леонидовна Горун, младший научный сотрудник ФГБНУ «Федеральный научный центр риса»
Сергей Александрович Лесняк, младший научный сотрудник ФГБНУ «Федеральный научный центр риса»

DOI: https://doi.org/10.31857/S2500208224010034

Аннотация

В статье приведены результаты исследований по определению информативных ДНК-маркерных систем, обеспечивающих надежный контроль наличия локусов устойчивости к сосудистому бактериозу Хсс в селекционном материале капусты белокочанной. На начальном этапе работ 20 молекулярных маркеров, взятых из базы данных VegMarks, были апробированы на контрастных по резистентности к сосудистому бактериозу изогенных линиях капусты белокочанной (устойчивая линия 269-Яс12п-2 и восприимчивая Пи714). Установлено, что только SSR-маркер Ol10-С01 выявляет полиморфизм между контрастными образцами капусты белокочанной. Проведен ПЦР-анализ на растениях F₂ гибридной комбинации 269-Яс12п-2 х Пи714 с помощью данного полиморфного маркера и фитопатологическое тестирование. В результате статистического анализа расщепления обнаружено, что SSR-маркер Ol10-С01 – сонаследуемый с признаком устойчивости к сосудистому бактериозу, поскольку по этому локусу наблюдается ожидаемая сегрегация растений F₂ по генотипу 1:2:1 согласно закону Менделя и оптимальная частота рекомбинации между локусом устойчивости Хсс и маркером (13,7 %).

Литература

1. Батин Н.В. Компьютерный статистический анализ данных. Минск, 2008. 160 с.
2. Королева С.В., Дякунчак С.А., Ситников С.В. Иммунологическая оценка селекционного материала при создании гибридов F1 белокочанной капусты с групповой устойчивостью к фузариозу и сосудистому бактериозу (методические рекомендации). М., 2012. 16 с.
3. Королева С.В., Дякунчак С.А., Юрченко С.А. Создание гибридов F1 капусты белокочанной с комплексной устойчивостью на юге России // Овощи России. 2019. №4. С.16-20. https://doi.org/10.18619/2072-9146-2019-4-16-20
4. Кутлунина Н.А., Ермошин А.А. Молекулярно-генетические методы в исследовании растений. Екатеринбург, 2017. 142 с.
5. Нгуен М.Л., Монахос Г.Ф., Комахин Р.А., Монахос С.Г. Новый локус устойчивости к киле в хромосоме А05 капусты пекинской (Brassica rapa L.) // Генетика. 2018. Т. 54. № 3. С. 306-315.
6. Afrin K.S., Rahim M.A., Park J. et al. Screening of Cabbage (Brassica oleracea L.) Germplasm for Resistance to Black Rot. Mol. Biol. Rep. 2018. No. 5. PP. 773-785. https://doi.org/10.1007/s11033-018-4217-5
7. Cruz J., Tenreiro R., Cruz L. Assessment of Diversity Xanthomonas campestris Pathovars Affecting Cruciferous Plants in Portugal and Disclosure of two novel Xcc races. Plant Pathol. 2017. No. 9. PP. 403-414 https://doi.org/10.4454/jpp.v99i2.3890
8. Kifuji Y., Hanzaea H., Terasawa Y., Nishio T. QTL analysis of black rot resistance in cabbage using newly developed EST-SNP markers. Euphytica. 2013. No. 190. PP. 289-295. https://doi.org/10.1007/s10681-012-0847-1
9. Lee J., Izzah N.K., Jayakodi V. Genome-wide SNP identification and QTL mapping for black rot resistance in cabbage. BMC Plant Biol. 2015. No. 15 (32). P. 11. https://doi.org/10.1186/s12870-015-0424-6
10. Murray M.G., Thompson W.F. Rapid isolation of high molecular weight plant DNA. Nucleic Acids Research. 1980. V. 10. P. 4321-4325.
11. Sharma B.B., Kalia P., Yadava D.K. et al. Genetics and molecular mapping of black rot resistance locus Xca1bc on chromosome B-7 in Ethiopian mustard. PLoS ONE. 2016. No. 11 (3). P. 13. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0152290
12. Singh D., Raghavendra B.T., Singh P. et al. Detection of black rot disease causing pathogen Xanthomonas campestris pv. campestris by bio-PCR from seeds and plant parts of cole crops Seed Sci. & Technol. 2014. No. 42. PP. 36-46. http://doi.org/10.15258/sst.2014.42.1.04
13. Tonu N.N., Doullah M.A., Shimizu M. et al. Comparison of Positions of QTLs Conferring Resistance to Xanthomonas campestris pv. campestris in Brassica oleracea. American Journal of Plant Sciences. 2013. No. 4. PP. 11-20. http://dx.doi.org/10.4236/ajps.2013.48A002
14. Vicente J.G., Holub E.B. Xanthomonas campestris pv. campestris (cause of black rot of crucifers) in the genomic era is still a worldwide threat to brassica crops. Mol. Plant Pathol. 2013. No. 14(1). PP. 2-18. https://doi.org/10.1111/j.1364-3703.2012.00833.x
15. Vo Thi Ngok Ha, Dzhalilov F.S., Mazurin E. et al. Use of essential oils for disinfection of cabbage seed from black root Zasch. Kart. 2014. No. 2. PP. 26-28 http://www.kartofel.org/zakart/zakart2_2014.pdf